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江南荸荠展现出独特的形态特征,其根状茎呈匍匐状,构成稀少或众多的丛生或密集生长的茎丛。茎体稍显柔软,干燥后扁平,高度通常在20-50厘米之间,直径为1-2毫米。茎干上可见明显的肋条和纵槽,带有横脉,干后脉纹稍显隆起,形成疣状纹理。叶片少见,仅在小穗基部的两侧有两个叶鞘,叶鞘的下部呈现淡红色或褐色,上部则是绿色,鞘口呈截形,高度范围在3-10厘米之间。
小穗的形状为长圆状披针形,顶端钝或近尖,长度可达10-18毫米,基部直径为3-4.5毫米,颜色为淡血红色,内部包含大量的花朵。在小穗基部,有两个中空的鳞片,它们没有花,下一片鳞片会包裹住小穗基部的大部分。其余鳞片都有花,同样呈长圆状披针形,顶端尖锐,长度3.5-4.5毫米,宽1-1.5毫米,颜色为淡血红色,背部颜色较淡,边缘狭小,质地干膜质,中脉为淡绿色。下位刚毛有4条,长于小坚果的一半至一倍,稍硬挺,淡绣红色,有倒刺且刺短而密。柱头有两个。
小坚果的形状倒卵形,具有双凸的轮廓,长度在1.1-1.3毫米,宽度为0.7-0.8毫米,颜色以黄色或淡黄色为主。花柱基部呈狭圆锥形,顶端尖锐,长度约为小坚果的一半,宽度约是小坚果的三分之一。整个植物的花果期在4月至8月之间,展示了江南荸荠的鲜明季节性特征。