如何用单细胞发一区文章?这些宝藏单细胞数据库可以帮到你!

发布网友发布时间：2024-10-18 21:36

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单细胞分析在生命科学领域展现巨大潜力，众多数据库为单细胞数据探索与研究提供支持。以下精选数据库，助力科研人员进行细胞注释与分析：

1. scRNASeqDB：人类单细胞转录组数据库，包含38个人类细胞系/类型数据，共计13440个样本，支持基因/细胞类型搜索，提供可视化工具，浏览数据库数据信息。

2. CancerSEA：解析癌症单细胞功能状态，关联蛋白编码基因与lncRNA，支持25种癌症的41900个肿瘤细胞查询，14种功能状态分析。

3. Cell Blast：提供高质量参考数据库，用于细胞注释与跨数据集研究，实现细胞类型鉴定与新类型发现。

4. CellMarker：收录10万篇论文，提供细胞标志物、组织类型、细胞类型、癌症信息等4124个条目，覆盖人类/小鼠组织细胞类型。

5. ColorCells：分析单细胞RNA-Seq数据中lncRNAs表达、分类和功能，基于6物种167913个数据集，聚焦单细胞lncRNA研究。

6. HCA Human Cell Atlas：人类细胞图谱计划，包含大规模、全面的单细胞数据，关注人正常组织，提供数据下载与分析。

7. HCL Human Cell Landscape：人类细胞图谱研究成果，包含702,968个单细胞数据，覆盖102种细胞大类和843种细胞亚类，支持细胞类型鉴定。

8. CDCP Cell-omics Data Coordinate Platform：适合单细胞数据分析入门，集成7015个样本与1775570个细胞数据，提供分析、可视化、下载功能。

9. SCP Single Cell Portal：收录419个研究、1934万细胞单细胞数据库，数据持续更新，支持简单在线分析。

10. SCPortalen：提供人类、小鼠单细胞转录组元数据与转录组数据，支持搜索、浏览与下载，实现数据在线可视化。

11. signatureDB：细胞数据库，提供表格形式的基因表达数据，仅支持数据下载与研究。

12. SpatialDB：单细胞空间转录组数据库，收录5个物种的24个数据集，支持在线可视化与空间差异基因分析。

13. KIT Kidney Interactive Transcriptomics：肾脏单细胞数据分析数据库，整合多种肾脏组织数据，构建在线分析平台。

14. BloodSpot：包含正常人/AML患者、正常鼠血细胞基因表达，支持多种在线分析，可导出图片结果。

15. SC2disease：提供不同病例与健康对照、不同细胞类型间基因表达差异，助力探索细胞特异性基因。

16. PanglaoDB：单细胞转录组数据库，超过1000个实验的预处理分析，支持细胞分群注释，适用于人类/小鼠研究。

17. SCEA Single Cell Expression Atlas：收录18个物种、229个研究、597万个细胞的单细胞数据，支持基因/实验检索与下载。

18. Tabula Muris：小鼠生命周期内20个器官的单细胞数据，分离100,000多种细胞类型，实现功能注释与数据挖掘。

19. GRNdb：提供转录因子与靶基因网络，基于单细胞转录组数据，适用于人类/小鼠研究条件。

20. Jingle Bells：免疫相关单细胞数据库，聚焦免疫领域研究，支持在线分析与结果导出。

21. VascularSingleCell：收录人/小鼠脑血管、肺血管单细胞数据，提供血管系统细胞数据资源。

22. 非小细胞肺癌数据库：完成非小细胞癌患者外周血、组织单细胞测序，研究T细胞功能亚群与免疫特征。

以上数据库覆盖了从人类到小鼠，从正常组织到疾病状态的广泛研究领域，为科研人员提供丰富的单细胞数据资源与分析工具，加速单细胞生物学的研究进程。