1、消毒通常指的是将病原微生物杀死，但是不能有效的将细菌芽孢给杀死。一般都会使用化学的方法来达到非常好的消毒效果，一般这种化学药剂被称为消毒剂，并且消毒也是为了防止病原体在社会中散播，防止流行病的发生。其次也是为了防止病人之间出现交叉感染的情况，再者是为了保护医护工作人员避免被传染。
2、灭菌是用强烈的理化因素将物体中或者外部的所有微生物都杀灭，让这些微生物失去繁殖能力和生长能力，灭菌使用的方法有射线灭菌，湿热灭菌，干热灭菌和过滤除菌等，并且需要根据不同的效果来采用不同的灭菌方法。
3、消毒是将一部分微生物杀灭的方法，而灭菌是将所有微生物杀灭的方法，在医疗环境中有非常好的作用和效果，让人们在医院中能有更好的治疗环境。