当EB病毒发作时，除轻型病例外，均会出现发热，约38.5~40摄氏度，无固定热型。部分患者伴有畏寒、寒战，热程不一，数日至数周，也有长达2~4个月者。发热减退多伴有出汗。
淋巴结肿大
传染性单核细胞增多症患者70%会出现淋巴结肿大，一般在病程第一周即可出现，浅表淋巴结普遍受累，以颈部淋巴结最为常见，腋下、腹股沟次之，胸廓、纵膈、肠系膜淋巴结偶尔亦可累及。直径1~4cm，呈中等硬度，分散而不粘连，无明显压痛，不化脓，两侧不对称。肠系膜淋巴结受累时可有腹痛等症状。
肝功能异常
当EB病毒发作时，约2/3病例可出现肝功能异常，如谷丙转氨酶（ALT）升高，也有部分患者会出现黄疸。
肝脾大
EB病毒发作时，大约10%的病人有肝大，多在肋下2厘米处。半数患者有轻度脾大，有疼痛及压痛，少见发生脾破裂。
咽峡炎
大约半数的患者咽部、扁桃体充血肿胀，少数有溃疡或假膜形成，伴有咽痛，肿胀严重者可出现呼吸困难或吞咽困难。
其他少见症状
少数可出现神经系统症状，表现为急性无菌性脑膜炎、脑膜脑炎、脑干脑炎、周围神经炎等，偶尔见心包炎、心肌炎、肾炎或肺炎，腹泻等。
EB病毒症状会咳嗽吗
会咳嗽，但很少见，多为伴随症状。
咳嗽是不属于EB病毒常见症状的，当EB病毒发作时，出现发热，咽喉扁桃体炎症时，咽喉部受到刺激出现咳嗽，但不常见，不是主要病症。