犯本罪的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金；有下列情形之一的，处七年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产：（一）组织他人偷越国（边1境集团的首要分子；（二）多次组织他人偷越国（边）境或者组织他人偷越国（边）境人数众多的；（三）造成被组织人重伤、死亡的；所谓造成被组织人重伤、死亡的，是指组织他人偷越国（边）境的行为的本身过失而引起了被组织者重伤、死亡结果的发生。如果组织者对所造成的被组织者重伤、死亡结果持故意心理时，则应另定故意杀人罪或故意伤害罪，与组织他人偷越国（边）境罪实行并罚。（四）剥夺或者限制被组织人人身自由的；（五）以暴力、威胁方法抗拒检查的；所谓以暴力、威胁方法抗拒检查的，是指采用身体强制或打击，造成一般的伤害或轻伤害的行为或采用威胁方法抗拒检查。如果行为人故意采用杀、伤方法抗拒检查，致人重伤或死亡的，对杀、伤检查人员的、应依法定罪判刑，然后同组织他人偷越国（边）境实行并罚。（六）违法所得数额巨大的；（七）有其他特别严重情节的。犯组织他人偷越国（边）境罪的违法所得和供犯罪使用的犯罪分子所有的或者明知他人为犯罪使用而提供其本人所有的运输、通讯工具或者其他财物，一律予以没收。
一、本罪与它罪的界限
(一)本罪与组织他人偷越国(边)境罪的界限
二罪的区别是明显的，主要区别在于客观方面不同。运送他人偷越国(边)境罪表现为为他人提供运输工具，并且将他人送出或送入国(边)境。组织他人偷越国(边)境罪表现为采取煽动、串连、拉拢、引诱、欺骗、强迫等手段，策划联络安排他人偷越国(边)境。
司法实践中，经常表现为既组织又运送的行为，对此如何定罪，我们认为如果组织和运送的是同一批偷越国(边)境者，按组织他人偷越国(边)境罪定罪处罚。如果既组织他人偷越国(边)境，又运送他人偷越国(边)境、这些偷越国(边)境又不是同一批的，应定组织他人偷越国(边)境罪和运送他人偷越国(边)境罪两罪，二罪并罚。
(二)本罪一罪与数罪的问题
本条第2款规定：“对被运送人有杀害、伤害、强奸、拐卖等犯罪行为，或者对检查人员有杀害、伤害等犯罪行为的，依照数罪并罚的规定处罚”。在运送他人偷越国(边)境犯罪过程中，对被运送人有杀害、伤害、强奸、拐卖等犯罪行为，或者对检查人员有杀害、伤害等犯罪行为的，运送他人偷越国(边)境罪与杀人、伤害、强奸等这几种犯罪是独立的数罪关系，因此，应当按照运送他人偷越国(边)境罪和另外实施的故意杀人、故意伤害、强奸等犯罪行为，分别定罪判刑，然后实行并罚。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国刑法》第三百一十八条组织他人偷越国(边)境的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金；有下列情形之一的，处七年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产：(一)组织他人偷越国(边)境集团的首要分子；(二)多次组织他人偷越国(边)境或者组织他人偷越国(边)境人数众多的；(三)造成被组织人重伤、死亡的；(四)剥夺或者限制被组织人人身自由的；(五)以暴力、威胁方法抗拒检查的；(六)违法所得数额巨大的；(七)有其他特别严重情节的。犯前款罪，对被组织人有杀害、伤害、强奸、拐卖等犯罪行为，或者对检查人员有杀害、伤害等犯罪行为的，依照数罪并罚的规定处罚。