花卉种类繁多，其种子的形态、颗粒大小、种皮厚薄、种子色泽、成熟期均有很大的差异。
种子采集是一项季节性很强的工作，必须做到适时。种子应从生长健壮，无病虫危害，花色、花型优良的植株上采收。同一植株主干及靠近主干的侧枝所结的种子较饱满，植株向阳面结的种子品质较好。种子的采集应在晴朗无风的清晨进行。所采集的种子必须是籽粒充分成熟的，若使用未充分成熟的种子繁殖，其后代瘦弱，而且极易发生品种退化。
成熟种子的特征一般为：含水量减少、重量增加、种粒饱满坚实、种皮硬度加大、种皮内的叶绿素消失，并且拥有固定的颜色和光泽。不同的花卉品种其种子成熟特性不同，应采取不同的采收方法。
种子成熟后易飞散的花卉，如凤仙花，可在种子成熟前套袋，使种子飞落袋内进行生理后熟，然后收藏。霜后才成熟，需进入室内采收的种子，如瓜叶菊等，在花谢后移入温室内，但晴天每日必须在室外接受2-3小时的阳光照射，才能使种子饱满。
如果始终在室内光照不足的条件下，所结的种子瘪籽率大。边开花，边结籽的花卉，如长春花、醉蝶花等，最好采收首批成熟的种子。早开花结实的种子繁殖出的后代一般花朵大、花色艳丽。籽种成熟度一致的花卉，如石竹、桂竹香等，可在全株籽种大部分成熟时将果枝剪下采收。
采收后的种子要及时去除杂质，进行晾晒，阴干，筛选。筛选出优质的种子，放干燥、通风、低温（温度在l-5℃）、低湿处(湿度在30%-40%)贮存。同时应注明采集地点、日期、品种、特征等。
种子的寿命长短有很大的差异。主要是由花木遗传性决定的，但贮藏的条件也大大影响着种子的发芽率。一般含水量多的种子在低温条件下发芽率容易降低，而干燥种子在低温条件下能长久保持发芽率。