按摩涌泉可催经血液循环，刺激到妇女的性腺反射区，而妊娠期以及经期妇女按摩的话，可能影响妇女及胎儿的健康，加重经期血量或减少，因此此时不宜按摩涌泉。
患有各种严重出血病的人如有咯血、吐血、便血、脑出血、胃出血、子宫出血及其他内脏出血等症的人群，在进行涌泉按摩时，可能会导致局部组织内出血的现象，故出血患者要禁按涌泉。
肾衰竭病人虽然按摩涌泉穴有利于肾脏健康，但像患有肾衰竭的患者而言，其病情危重，而按摩此穴位又会刺激肾部，可能引起肾脏出现强烈反应，使病情复杂恶化，建议不要乱按。
急性发病期人群像是一些急性的传染病、急性的中毒、外科急症的患者本身就处于病期发展期，此时应尽量休息，不可随意按摩涌泉或运动，否则按摩刺激身体血液流通过快都有加重病期的风险。
刚吃完饭1小时以内的人按摩涌泉时血管会扩张、血容量会增加，容易造成胃肠及内脏血液减少，影响胃肠消化功能。因此按摩涌泉最佳时间应是即饭前或饭后，建议在每天下午的5点到7点按摩，此时肾经最活跃，按揉的效果也最好。
足部有伤者包括外伤、水疱、疥疮、发炎、化脓、溃疡、水肿及较重的静脉曲张的患者，尤其是骨折患者更不易按摩涌泉穴，否则会加重伤情，不利于康复。
特殊人群正处于大怒、大悲、大喜之中或精神紧张、身体过度疲劳时不宜按摩涌泉穴，此时按摩会不利于身心健康甚至造成痛感强烈现象，最好是等恢复了之后再按摩为好。
按摩涌泉的副作用正确按摩涌泉穴是没有副作用的。
涌泉穴位于足底前部凹陷处，是足少阴肾经的重要穴位，如正确按摩涌泉穴是没有副作用的，反而可使肾脏代谢加强，排出体内毒素的能力提高，加快水液代谢，改善下肢浮肿的症状，但若是用力过度或按摩频繁，对于某些人疼痛敏感的人来说可能出现较长时间的局部疼痛酸胀感，建议调整按摩力度和次数，多用温水泡脚缓解疼痛即可。