1、生产原料不同
虽然碧根果和巴旦木都属于坚果一种，但两者生产时所用到的原料会有所不同，其中巴旦木来自巴达木或巴旦杏，而碧根果是来自胡桃科植物的果实，又叫薄壳山核桃。
2、产地不同
巴旦木多产自亚洲西部，而碧根果多产自北美洲。
3、外观不同
巴旦木又叫薄壳杏仁，所以果仁形状和杏仁比较相似，但是巴旦木外层还有一点褐色的外皮，壳也比较薄好剥；而碧根果又叫薄壳山核桃，果仁的外观和核桃仁相似吗，只是核桃外壳偏圆，而碧根果的外壳偏椭圆。