依据我国刑事诉讼法的规定，申请法官回避的，应该由审理案件法院的院长作出决定。《中华人民共和国刑事诉讼法》第三十一条
审判人员、检察人员、侦查人员的回避，应当分别由院长、检察长、公安机关负责人决定；院长的回避，由本院审判委员会决定；检察长和公安机关负责人的回避，由同级人民检察院检察委员会决定。对侦查人员的回避作出决定前，侦查人员不能停止对案件的侦查。对驳回申请回避的决定，当事人及其法定代理人可以申请复议一次。
第三十二条本章关于回避的规定适用于书记员、翻译人员和鉴定人。辩护人、诉讼代理人可以依照本章的规定要求回避、申请复议。
一、申请回避的理由
根据民事诉讼法第四十五条的规定，审判人员、书记员、翻译人员、鉴定人和勘验人有下列情形之一的，必须回避：
1.是本案的当事人或者当事人、诉讼代理人的近亲属。本案的当事人，包括原告、被告、有请求权第三人和无请求权第三人。当事人是实体权利的享有者和义务的承担者，只能以当事人的身份参加诉讼，而不能以当事人和办案人员的双重身份出现，所以必须回避。当事人、诉讼代理人的近亲属，是指本案当事人或诉讼代理人的配偶、父母、子女、兄弟姐妹、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女。
2.与本案有利害关系。所谓与本案有利害关系，是指案件的处理结果直接或间接地涉及到审判人员自身的利益。这种利害关系，既可能是法律上的利害关系，也可能是事实上的利害关系。
3.与本案当事人有其他关系，可能影响对案件公正审理的。其他关系，指除上述关系以外的其他关系。比如，与当事私交甚笃的同学、朋友或与当事人积怨很深的仇人、对手，等等。这些关系，只要可能影响案件公正审理的，就应当回避。