软件著作权登记证书有以下作用：
1、软件著作权登记证书能够起到向外公布登记事项的作用；
2、软件著作权登记证书能够对产生软件著作权的案件起到相应的证据作用。
一、软件著作权有效期是多长时间
法律对于软件著作权有效期，其规定一般指的是保护期为自然人终生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日，软件是合作开发的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日，这是个人软件著作权的有效期。而如果是法人的著作权，那么法人或者其他组织的软件著作权，保护期为50年，截止于软件首次发表后第50年的12月31日，但软件自开发完成之日起50年内未发表的，本条例不再保护。
二、软著可以转让给其他公司吗
软著可以转让给其他公司。软件著作权转让是指软件著作权人作为转让方与受让方通过签订转让合同的方式，将软件著作权的全部或者其中的一部分权利转移给受让方所有，而由受让方支付相应的转让费的法律行为。软件著作权转让分为两种，一种是当事人转让给公司。另外一种是公司转公司。转让合同中应当明确转让的软件名称及版本号、转让权利范围、转让地域范围、合同生效日期等内容。
三、版权申请流程
版权，用法律上的术语，也称著作权。主要分为作品著作权和计算机软件著作权。若要申请版权，则申请流程为：1.申请人提交登记申请材料；2.登记机构核查接收材料；3.通知缴费；4.申请人缴纳登记费用；5.登记机构受理申请；6.审查；7.制作发放登记证书；8.进行公告。
【本文关联的相关法律依据】
《计算机软件保护条例》第六条
本条例对软件著作权的保护不延及开发软件所用的思想、处理过程、操作方法或者数学概念等。
第七条
软件著作权人可以向国务院著作权行政管理部门认定的软件登记机构办理登记。软件登记机构发放的登记证明文件是登记事项的初步证明。
办理软件登记应当缴纳费用。软件登记的收费标准由国务院著作权行政管理部门会同国务院价格主管部门规定。