免除刑事处罚是会留案底的。在中国，任何公民只要构成犯罪，就会留有案底，而且会伴随该公民的一生。免予刑事处罚只免除被告人的刑事处罚，而不免除被告人的刑事责任，免予刑事处罚也是我国刑法的一项规定。例如，中止犯没有造成伤害的，就可以免除其刑事处罚；如果造成轻微伤害，则可以减轻处罚。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国刑法》第一百条前科报告制度，依法受过刑事处罚的人，在入伍、就业的时候，应当如实向有关单位报告自己曾受过刑事处罚，不得隐瞒。
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