法律分析：分两种情况。1、非跨省工程的分包，由扣缴人在工程所在地代扣代缴；2、其二，跨省工程的分包，由扣缴人在扣缴人的机构所在地代扣代缴;如果分包人将工程再一次分包出去，有一段工程仍是跨省工程，该段跨省工程的营业税亦由总承包人在其机构所在地代扣代缴。
法律依据：《税务征收管理法实施细则》第三十条 税务机关应当建立、健全纳税人自行申报纳税制度。纳税人、扣缴义务人可以采取邮寄、数据电文方式办理纳税申报或者报送代扣代缴、代收代缴税款报告表。数据电文方式，是指税务机关确定的电话语音、电子数据交换和网络传输等电子方式。
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