法律分析：企业纳税申报的流程如下：
1、在法定的申报期限，如实办理纳税申报，报送纳税申报表；
2、税收机关审查申请材料；
3、符合扣税标准的，扣除税款，并发给扣除证明。
公司需要缴纳以下税种：
1、增值税；
2、企业所得税；
3、印花税；
4、土地增值税；
5、城市维护建设税和教育费附加应纳城市维护建设税；
6、堤围防护费。
综上所述，企业纳税通过在网上下载填写申请表后，再到税务登记机关办理税务登记后，开通相应的权限，最后再登录网站进行纳税申报。企业应当缴纳的税种包括六种，具体的税率根据当地的政策确定。
法律依据：《中华人民共和国企业所得税法》
第五条 企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
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