夫妻满两年不同居可以申请离婚婚姻关系。但是只能通过离婚登记或者法院判决或调解的方式解除。分居，不管时间多长，都不能自动解除婚姻关系。但是，按照民法典的规定，夫妻因感情不和分居满二年，则构成夫妻感情确已破裂，在诉讼中，如果调解不成，应当判决准予离婚。但是非因感情不和而分居的，不能适用该项规定。
离婚的方法有：
1、协议离婚，需要双方就是否离婚、子女抚养权、财产分割等内容达成一致，形成纸质离婚协议，并将双方户口本原件、身份证原件、结婚证原件带到任何一方户籍所在地民政局办理手续；
2、诉讼离婚，需携带诉状、身份证原件等向法院提起诉讼。
协议离婚的流程如下：
1、当事人申请；
2、婚姻登记机关初审；
3、发《离婚登记申请受理回执单》；
4、30天离婚冷静期届满申请发给离婚证；
5、婚姻登记机关审查；
6、登记、发给离婚证。
法律依据：《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
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