农村自建房离婚的分配如下：
1、双方均主张房屋所有权并且同意竞价取得的，应当准许；
2、一方主张房屋所有权的，由评估机构按市场价格对房屋作出评估，取得房屋所有权的一方应当给予另一方相应的补偿；
3、双方均不主张房屋所有权的，根据当事人的申请拍卖房屋，就所得价款进行分割。
根据相关法律规定可知，在离婚时，夫妻双方可以协议分割房产，在双方无法达成协议时候，双方对夫妻共同财产中的房屋价值及归属无法达成协议时，人民法院按照上述情形处理。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第一千零八十七条 离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
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